Фамилия Туйгунова — женская форма фамилии Туйгунов, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: такую фамилию давали по отцу или главе семьи. Но основа «Туйгун» явно не славянская, и здесь кроется главная загадка.

Скорее всего, корни фамилии — тюркские. В тюркских языках, особенно в башкирском, татарском или казахском, распространены личные имена с элементом «туй», что означает «праздник», «свадьба» или «пир». Вторая часть «гун» может восходить к слову «кюн» (день) или к древнетюркскому «гун» (солнце, свет). Таким образом, «Туйгун» могло быть личным именем-пожеланием, которое переводится как «праздничный день» или «светлый праздник». В старину такие составные имена давали детям, чтобы подчеркнуть радость от их рождения или призвать в жизнь благополучие.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с башкирским или татарским словом «туйгын» (устойчивый, сытый, довольный). Тогда прозвище Туйгун могло характеризовать человека как зажиточного, не знающего нужды. В ономастике известны случаи, когда подобные прозвища переходили в фамилии, особенно в среде крестьян и служилых людей.

Географически фамилия Туйгунова встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Башкортостане, Татарстане, в Оренбургской и Челябинской областях. Встречается она и в Казахстане, что подтверждает её тюркское происхождение. Социальный статус предков Туйгуновых, скорее всего, был крестьянским или казачьим — фамилия не дворянская, а народная, возникшая в среде, где личные имена и прозвища давали по ярким, запоминающимся признакам.

Написание фамилии с буквой «у» во втором слоге (Туйгунова, а не Туйгонова) также указывает на тюркский источник: в русской транскрипции тюркское «у» обычно сохраняется. Если бы фамилия была исконно русской, форма могла бы звучать иначе, например, с суффиксом -ин (Туйгунин). Но суффикс -ов здесь — знак того, что фамилию «обрусели» по стандартной модели, адаптировав для русской документации.