Фамилия Убугунов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а, скорее всего, географическое название или этноним, причем с явным восточным колоритом. Разбирать её стоит не с суффикса, а с корня, потому что именно он ставит главный вопрос.

Корень «Убугун» отчетливо напоминает бурятское или монгольское слово «убгэн» (старик, старец) или его диалектные варианты. В бурятском языке «убгэн» — это не просто возраст, а уважительное обращение к мудрому, почтенному человеку, часто к шаману или главе рода. Фамилия могла образоваться от прозвища Убугун, которое дали либо самому старшему в роду, либо человеку, который выглядел или вёл себя по-старчески смолоду. Вторая версия — от названия местности: в Забайкалье и Бурятии встречаются урочища и речки с похожими названиями (например, Убугун — один из притоков Селенги). Тогда предок получил фамилию по месту жительства: «Убугунов» — выходец с речки Убугун.

Суффикс «-ов» в данном случае не типичен для бурятских фамилий (там чаще встречаются окончания на «-ев», «-ин» или вовсе без суффикса, как у Гомбоев, Цыренов). «-ов» — это русская патронимическая модель, которую накладывали на инородные имена при крещении или при переходе в оседлость. Поэтому Убугунов — это, скорее всего, обрусевшая форма исходно бурятского прозвища или топонима. Если бы фамилия осталась в исконной среде, она могла бы звучать как Убугун (без суффикса) или Убугунский.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Бурятии, Иркутской области или Забайкальскому краю — регионам, где исторически жили буряты и где русские писцы адаптировали местные имена под привычные модели. Социальный контекст: предки Убугуновых могли быть скотоводами, охотниками или казаками, но точных данных об их сословной принадлежности нет — фамилия слишком редкая, чтобы делать обобщения.

С точки зрения словообразования, это классический пример «русификации» нерусского прозвища: основа + русский суффикс принадлежности. Никакой другой модели (например, на «-ский» или «-их») у фамилии нет. Спорных версий немного, и самая слабая — связь с тюркским «убук» (потомок) — не подтверждается ни фонетически, ни ареально: бурятский вариант выглядит убедительнее, потому что именно в бурятской среде такая фамилия встречается чаще всего.