Фамилия Устилкин образована по продуктивной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Устилкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Устилка. В основе лежит уменьшительная форма от крестильного имени Устин (каноническая форма Иустин, от латинского justus — «справедливый»). Имя Устин в старину было распространено в простонародной среде, а его уменьшительные варианты — Устинка, Устя, Устилка — встречались в быту повсеместно.

Однако возможен и другой путь: прозвище Устилка могло закрепиться за человеком, который постоянно что-то устилал — стелил сено, солому, половики. Глагол «устилать» (стелить, покрывать) в северных и центральных говорах употреблялся широко, в том числе в переносном значении «улаживать, успокаивать». В таком случае фамилия несет профессиональный или поведенческий оттенок.

Интересно, что суффикс -к- в основе (Устил-к-а) — типичный признак обиходного имени или прозвища, которые в XV–XVII веках часто становились фамилиями без дополнительных суффиксов, а затем закреплялись через -ин. Сравните с фамилиями Устинов (от полной формы имени) и Устинкин (от другой уменьшительной формы) — Устилкин стоит особняком, так как вторая ступень уменьшительности (Устил-ка) встречается реже.

По данным исторических документов, фамилия Устилкин фиксируется преимущественно в центральных и южнорусских регионах, в частности в бывшей Тульской и Рязанской губерниях, где имя Устин было популярно среди крестьян и посадских людей. Дворянских ветвей с такой фамилией не отмечено — это однозначно фамилия простого сословия, закрепившаяся в эпоху, когда крестьяне и мещане получали наследственные прозвания по имени или занятию отца.

Таким образом, Устилкин — характерная русская фамилия, чей корень уходит либо в личное имя Устин, либо в прозвище, связанное с ремеслом или бытовой чертой, и образованная по живому народному словообразованию.