Фамилия Узекин образована от прозвища или нецерковного имени Узека. Основа здесь — глагол «узекать» или «узекать», который в южных и западных говорах означал «увидеть, приметить, заметить». В словаре Даля «узекать» — «усмотреть, углядеть, учуять». Человек, получивший прозвище Узека, вероятно, обладал острым зрением или особым чутьём, был наблюдательным, всё подмечал. В некоторых диалектах слово имело оттенок «высмотреть, выведать», так что прозвище могло закрепиться за соглядатаем или любопытным человеком.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Узекин — сын Узеки. Это типичная русская модель образования фамилий от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я (сравните: Фомин от Фома, Кузьмин от Кузьма). Форма Узека — краткая, усечённая, характерная для разговорной речи, что говорит о бытовом, неофициальном происхождении прозвища.

Фамилия редкая. Встречается в основном в центральных и южных областях России, особенно в Тамбовской и Рязанской губерниях, где диалектный глагол «узекать» был в ходу. В письменных источниках XIX века Узекины фиксируются как крестьяне и мещане. Дворянских родов с такой фамилией нет — это стопроцентно крестьянская или посадская фамилия.

Однокоренные фамилии — Узека, Узеков, Узековский. Узекина иногда путают с фамилией Уздкин (от «узда»), но это разные корни. Встречается вариант написания через «о» — Узёкин, что связано с произносительной нормой: под ударением «ё» в говорах звучало как «е».