Фамилия Ужовникова — женская форма фамилии Ужовников, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. В основе лежит слово «ужовник». В русских говорах так называли не только человека, имевшего отношение к ужам (например, ловца змей или знахаря, заговаривавшего укусы), но и растение. Ужовником в народе именовали некоторые травы, которые, по поверьям, помогали от укусов змей, — например, веронику змеевидную или плаун-баранец. Таким образом, прозвище Ужовник мог получить либо человек, занимавшийся ловлей или продажей ужей, либо травник, лекарь, собиравший «ужовник» для снадобий.

Суффикс «-ов» в фамилии Ужовников указывает на типичную русскую патронимическую модель, но не на прямое отчество. Фамилия образована не от имени Уж, а от прозвища Ужовник по схеме «чей сын?» — Ужовников, то есть потомок Ужовника. Такая форма встречается реже, чем простая модель на «-ов» без наращения «-ник», что делает фамилию более громоздкой, но и более точной: она буквально означает «сын того, кого звали Ужовник», а не «сын Ужа».

Географически фамилия Ужовников (и Ужовникова) тяготеет к южнорусским и центральным областям, где змеи встречались чаще и имели хозяйственное значение. В северных говорах ужовником могли называть и болотистую местность, обилие ужей, но прозвище там было бы менее вероятно. В документах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется как распространённая — это скорее редкая, локальная фамилия, не попавшая в массовые списки дворянства или купечества. Скорее всего, предки Ужовниковых были крестьянами или посадскими людьми, чьё прозвище закрепилось за родом из-за необычного занятия или особенности места жительства.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Ужов, Ужев, Ужиков — показывает, что Ужовникова стоит особняком. Если Ужов могло произойти напрямую от «уж» (змея) или от имени Уж (редкое неканоническое имя), то «ужовник» — это уже конкретный деятель или предмет. Поэтому версия с растением кажется чуть более правдоподобной: прозвище «травник» было понятным в деревне, а «ужовник» как название травы — распространённым ботаническим термином в народной медицине.