Фамилия Ваенро — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет совершенно нерусское происхождение. Если смотреть на её окончание, она вписывается в модель фамилий на -о, которые характерны для украинской ономастики (сравните: Довженко, Нестеренко). Но основа «Ваенр» не похожа ни на одно из известных славянских прозвищ или имён.

Здесь почти наверняка работает другой механизм: фамилия Ваенро — это русифицированная запись иноязычной фамилии. Скорее всего, она восходит к еврейской фамилии Ваенрот (Waenrot) или Ваенроб, которая в свою очередь происходит от немецкого или идишского сочетания «Wahn» (заблуждение, иллюзия) и «Rot» (красный). В таком случае первоначальное прозвище могло означать что-то вроде «красное наваждение» или быть связанным с цветом волос, одежды или профессией красильщика. При переезде носителя в русскоязычную среду окончание могло измениться на -о по аналогии с украинскими фамилиями или просто из-за особенностей произношения.

Вторая, менее вероятная, но тоже возможная версия — финно-угорское происхождение. В карельском и финском языках есть корни, которые при адаптации могли дать «Ваенро» (например, от «vaien» — тишина, молчание, или от топонимов с основой «Vaa-»). Однако в этом случае фамилия скорее осталась бы в форме Ваяйнен или Ваенен. Фактическое бытование фамилии Ваенро в современной России единично: она встречается в основном на Северо-Западе и в Москве, что слабо подтверждает финскую гипотезу.

Самое надёжное объяснение — это миграционная трансформация. Фамилия могла появиться в результате ошибки писаря или сознательного упрощения сложной для русского уха западноевропейской фамилии. В любом случае, её носители — потомки людей, которые принесли в Россию не славянское имя, а, вероятно, еврейское или немецкое прозвище, изменившееся до неузнаваемости.