Фамилия Вафлершева — редкий пример фамилии, образованной не от славянского корня, а от западноевропейского профессионального прозвища. В её основе лежит немецкое слово Waffler (от Waffel — «вафля»). Так в Германии и Австрии называли пекаря или кондитера, который пёк вафли — лакомство, популярное в бюргерской среде с XVI века.

Русский суффикс -ев указывает на типичную модель присоединения к иноязычной основе, а окончание -а — на женскую форму фамилии, то есть Вафлершева — это «жена или дочь Вафлерша». Мужской вариант — Вафлершев. Обратите внимание на суффикс -ерш-, который в русских фамилиях встречается крайне редко: он передаёт немецкое -er, а затем добавляет русский патронимический суффикс -ш- (как в фамилиях Шефершев, Беккершев). Это говорит о том, что фамилия возникла в среде переселенцев или обрусевших немцев.

Носитель такой фамилии мог быть потомком приглашённых в Россию при Петре I или Екатерине II мастеров-кондитеров. Немецкие колонии в Поволжье, Причерноморье или Петербургская губерния — вероятные регионы, где могло появиться это прозвище. Фамилия не получила широкого распространения из-за сложности произношения для русского уха, поэтому её носители, скорее всего, немногочисленны и сосредоточены в местах исторического проживания немецких диаспор.

Других версий происхождения — от славянских корней или тюркских заимствований — нет: слово «вафля» пришло в русский язык именно из немецкого, и фамилия следует той же логике.