Фамилия Вагиносец — редкий случай в русской ономастике, и её разбор сразу вызывает вопрос: что за странный корень? На слух она кажется сложной, но на деле построена прозрачно. Основа здесь — «вагин-», а суффикс «-ец» указывает на принадлежность к месту или на носителя признака. То есть Вагиносец — это буквально «тот, кто из Вагина» или «житель Вагина».

Подвох в том, что слово «вага» в русских говорах означало не только «весы» или «тяжесть», но и «рычаг», «коромысло», а в северных диалектах — «колода», «бревно». В топонимике это дало множество названий: на карте России есть несколько деревень с именем Вагино, Вагинская, Ваганово. Фамилия, скорее всего, и возникла от названия такого села. Человек, переехавший в город или в другую волость, получал прозвище по месту выхода — Вагинец, а со временем форма закрепилась как Вагиносец. Суффикс «-ец» в этом типе фамилий (сравните: Тамбовец, Ростовец, Белозерец) — классический признак прозвища по географическому происхождению.

Менее вероятна, но не исключена версия от личного имени или прозвища Вага. В старых новгородских грамотах встречается имя Вага как сокращение от Вагрий (скандинавское имя) или как самостоятельное прозвище — человека сильного, грузного, «важного». Тогда Вагиносец мог означать «сын Ваги» или «человек из рода Вагиных». Но суффикс «-ец» редко работает как патронимический (для этого есть -ов/-ин), поэтому топонимическая версия убедительнее.

С точки зрения социального контекста, фамилия Вагиносец почти наверняка крестьянская или мещанская. Дворянские роды с таким окончанием — редкость, а в среде сельских жителей прозвища по деревням были обычным делом. Встречается она в основном на Русском Севере (Архангельская, Вологодская области) и в Сибири, куда переселенцы уносили с собой память о покинутом селе.

Любопытная деталь: написание через «о» (Вагиносец, а не Вагинец) — это не ошибка, а следствие того, что топоним Вагино склонялся по типу «из Вагина», и прозвище застыло в форме «Вагиносец», как «Вологодский» от «Вологда». Такая грамматическая архаика встречается у фамилий, которые не прошли через литературную норму и сохранили живую речь предков.