Фамилия Вахошкина — женская форма фамилии Вахошкин, и её происхождение напрямую связано с уменьшительно-ласкательной формой личного имени. В основе лежит имя Вахошка, которое является производным от полного крестильного имени Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли»). В русской народной традиции длинные имена часто сокращали и «обкатывали» до коротких обиходных вариантов: Варфоломей превращался в Вахра, Вахруш, а затем и в Вахошку. Суффикс -к- здесь придаёт разговорный, домашний оттенок, а окончание -а указывает на принадлежность к мужскому роду в исходной форме.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: от имени Вахошка через притяжательный суффикс -ин (чей? — Вахошкин сын) получили фамилию Вахошкин. Такая схема — одна из самых распространённых в центральной и северной России, где фамилии на -ин образовывались от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Вахошкина — это уже «жена или дочь Вахошкина», то есть женщина из рода, основатель которого носил имя Вахошка.

Географически фамилия встречается нечасто, и её очаги, судя по данным переписей и архивов, тяготеют к регионам, где имя Варфоломей было популярно в старину: Вологодская, Костромская, Нижегородская области. В этих краях крестьянские семьи нередко сохраняли архаичные формы имён, которые в городах уже вышли из обихода.

Интересная деталь: фамилия Вахошкин стоит в одном ряду с однокоренными Вахрушин, Вахрамеев, Вахонин — все они восходят к тому же корню «Вах-», ведущему к Варфоломею. Но в отличие от более частых вариантов, Вахошка сохранил редкий суффикс -ошк-, который в русской антропонимии встречается редко (сравните с Павел — Павлушка, но не Павлошка). Это делает фамилию отчётливой и легко отличимой от похожих.

Никакой связи с современным словом «вахта» или «ваххабизм» у фамилии нет. Основа чисто антропонимическая, и её значение сводится к одному: предок носительницы фамилии был человеком, которого в быту звали Вахошкой.