Фамилия Ванцына — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем прозрачная этимология. Если отбросить случайные совпадения, то почти наверняка её корни ведут на Русский Север, в архангельские и вологодские земли. Именно там, в бассейне Северной Двины, издавна бытовало слово «ванцы» — так называли большие сани для вывоза леса или сена. Человек, делавший такие сани или торговавший ими, получал прозвище Ванец или Ванца. От него-то и образовалась фамилия через типичный для этих мест суффикс принадлежности -ин: Ванцын (чей? — сын Ванцы). Форма Ванцына — это женский или родительный падеж, но в быту закрепилась именно она, что нередко случалось с фамилиями, записанными через жену или вдову.

Суффикс -ин в данном случае указывает на прямое родство: предка звали Ванца. Само же прозвище Ванец/Ванца могло иметь и другой смысл — так в некоторых говорах называли бортника или человека, занимавшегося лесным пчеловодством («ванить» — выкуривать пчёл). Но лесозаготовительная версия выглядит правдоподобнее: плотницкое и извозное ремесло на Севере было массовым, а прозвища по орудиям труда давали охотно.

Встречается и более экзотическая версия — от диалектного «ванька», «ваньця» (уменьшительное от Иван). Однако переход «нь» в «нц» для русских говоров нетипичен, а форма Ванцын не получила широкого распространения, в отличие от Иванов или Ваниных. Поэтому связь с конкретным ремеслом или предметом (сани) остаётся главной рабочей гипотезой.

Фамилия Ванцына — недворянская, крестьянская по происхождению. Она не попала в родословные книги, её носители — потомки тех самых северных мужиков, что валили лес, таскали сани и жили в деревнях вдоль Пинеги и Мезени. Сегодня фамилия встречается точечно, преимущественно в Архангельской области и у потомков северных переселенцев в Сибири.