Фамилия Вараткова — женская форма фамилии Варатков, и её происхождение стоит искать не в очевидных аналогиях, а в диалектных и профессиональных корнях. В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён, Варатков имеет прозвищную основу, которая почти не встречается за пределами нескольких регионов.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Вараток — уменьшительная форма от слова «варак» или «варака». В севернорусских говорах, особенно в архангельских и вологодских, «варака» — это холм, возвышенность, а также скалистый остров или обрыв у реки. В этом случае Варатком могли прозвать человека, жившего на возвышенности или у обрыва. Такая топонимическая модель типична для Русского Севера: фамилия указывает на место жительства, а не на занятие.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная, связывает прозвище с глаголом «варакать» — говорить вздор, болтать, а также делать кое-как, наспех. В этом случае Вараток — говорун или небрежный работник. Однако у этой гипотезы слабая поддержка: суффикс -ок в таких прозвищах встречается редко, и чаще использовалась форма «Варакуша» или «Варака».

Суффикс -ов в фамилии Варатков указывает на принадлежность: сын Варатка. Это стандартная патронимическая модель, но не от имени, а от прозвища. Фамилия редкая, её географическое распространение, по данным современных исследований, тяготеет к северным и центральным областям России, но не образует плотных гнёзд. Это говорит о том, что носители фамилии, вероятно, происходят из одной или нескольких крестьянских семей, где прозвище закрепилось как родовое.

Интересно, что фамилия Варатков не фиксируется в классических ономастических словарях — ни у Унбегауна, ни у Никонова, ни у Веселовского. Это указывает на её локальный характер и, возможно, позднее оформление (вторая половина XIX века), когда многие крестьянские прозвища стали официальными фамилиями. Поэтому для точного выяснения корня носителям фамилии стоит обратить внимание на местные говоры и географию предков — именно там, а не в общих справочниках, лежит разгадка.