Фамилия Ваторопина образована от прозвища Ваторопа. В тверских говорах это слово означало «второпях», «в спешке». Прозвище, скорее всего, закрепилось за человеком подвижным, торопливым, которого окружающие называли торопыгой.

Первое документальное упоминание относится к 1490 году. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского зафиксирован новгородский крестьянин Ваторопа — это самое раннее известное свидетельство бытования такого прозвища. Позже, в XVI–XVII веках, в Твери упоминаются служилые землевладельцы Ваторопины. Значит, фамилия могла сложиться в разных социальных слоях: и среди крестьян, и среди дворян.

Фамилия образована по типичной русской модели: к основе Ватороп- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Ваторопы). Окончание -а в современной форме — это женский вариант; мужская форма — Ваторопин. Носительница фамилии Ваторопина — прямой потомок человека, которого в старину прозвали Ваторопой.

Из известных людей эту фамилию носит Александр Сергеевич Ваторопин, социолог, специалист по культуре модернизма и постмодернизма. Окончательно определить точное место и время возникновения конкретной ветви рода можно только по результатам генеалогического исследования.