Фамилия Ватузов происходит от прозвища Ватуз, которое, в свою очередь, связано с глаголом «ватовать» — «подбивать ватой, стегать, класть вату». Эта основа указывает на профессиональное прозвище: Ватузом могли называть мастера, который занимался изготовлением стеганых одеял, телогреек или ватных кафтанов — вещей, необходимых в крестьянском и городском быту. В русских говорах слово «ватовать» означало именно работу с ватой и подкладкой, поэтому прозвище закреплялось за человеком по роду занятий.

Есть и другая версия: Ватузом в шутку могли прозвать человека, который кутался не по погоде, носил слишком теплую одежду. В этом случае прозвище отражало особенность характера или привычку, а не ремесло. Такие именования были распространены в среде, где меткое слово легко прирастало к человеку и передавалось дальше.

Сама модель фамилии — суффикс -ов — указывает на принадлежность: «чей?» — Ватузов, то есть сын или потомок Ватуза. В русской ономастике это стандартный способ образования фамилий от прозвищ, бытовавший в XVI–XVII веках, когда крестьянские и посадские семьи начинали обзаводиться наследственными именованиями.

Фамилия редкая, её географическое ядро, судя по доступным данным, не выходит за пределы центральных и поволжских областей России. Однокоренных фамилий немного: Ватутин, Ватулин — они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Ватузов стоит особняком именно из-за прозвищной основы, прямо связанной с ремеслом.