Фамилия Вайнаускас звучит непривычно для русского уха, но её происхождение прозрачно для литовского языка. Это типичная литовская фамилия, образованная по продуктивной модели с суффиксом -аускас. В литовской ономастике суффикс -auskas (женский вариант -auskienė или -auskaitė) указывает на происхождение от какого-либо места или на принадлежность к роду. Он соответствует польскому суффиксу -owski или русскому -овский.

Основа фамилии — личное имя или прозвище Вайнас (Vainas). В литовском языке слово vaina означает «ссора», «раздор», «тяжба». Соответственно, Вайнаускас — это потомок человека по прозвищу Вайнас, то есть «спорщик», «задира», «тот, кто любит судиться». Вряд ли прозвище было оскорбительным — в среде литовских крестьян и мелкой шляхты такое имя могло характеризовать человека неуступчивого, упрямого, готового отстаивать своё в суде или в драке.

Географически фамилия Вайнаускас и её варианты (Вайнаускайте, Вайнаускиене) распространены в Литве, особенно в Аукштайтии и Жемайтии. В русскоязычной среде фамилия встречается редко, обычно у потомков литовцев, переселившихся в Россию, Беларусь или Польшу в XIX–XX веках. В документах Российской империи литовские фамилии часто русифицировали: Вайнаускас мог писаться как Вайнаусков или Войнаусков, но подлинная форма сохранилась у тех, кто не утратил связи с литовским языком.

Любопытно, что в литовском языке есть и фамилия Вайна (Vaina), и Вайнис (Vainis), и Вайнутис (Vainutis). Все они восходят к той же основе — vaina. Фамилия Вайнаускас — одна из самых «прозрачных» по значению: она буквально называла предка «спорщиком», и это не было редкостью в аграрных общинах, где земельные тяжбы и соседские конфликты были обычным делом.