Фамилия Вайндрук — одна из тех, что сразу выдают географию и этническое происхождение носителя. Это не русская фамилия в исконном смысле, а еврейская, причем ашкеназская, то есть восходящая к языку идиш. Её основа — два корня: «вайн» (וויין — вино) и «друк» (דרוק — печать, нажим, давление). В буквальном значении «Вайндрук» можно перевести как «винная печать» или «винный оттиск».

Скорее всего, фамилия не описывает ремесло или профессию, а выполняла функцию прозвища или была искусственно создана при обязательной паспортизации еврейского населения в Российской империи и Австро-Венгрии в конце XVIII — XIX веках. Одна из версий: «Вайндрук» могли дать виноделу или торговцу вином, который ставил на бочки личное клеймо — «печать». Другая, более прозаичная, связывает фамилию с характером: «друк» на идише означает и «нажим», «упрямство», так что Вайндрук — человек, который «давит на вино», то есть настойчивый или прижимистый. Третья версия — топонимическая: в немецкоязычных землях существовали деревни с похожими названиями (например, Вайндрук в Баварии), откуда предки могли взять фамилию.

Суффиксальная модель здесь не работает — фамилия не получила славянского окончания (-ов, -ин, -ский). Это признак позднего закрепления на территории черты оседлости (Украина, Беларусь, Польша), где еврейские фамилии часто давали без адаптации к русской грамматике. В документах встречаются варианты написания: Вайндрук, Вайндрух, Вайндрукк, но основной — с «к» на конце.

Известных носителей с громкой исторической славой нет, что типично для фамилии, не попавшей в дворянские или купеческие родословные. В современной России и Израиле Вайндруки встречаются нечасто, но стабильно — это фамилия, сохранившаяся в семьях выходцев из Волыни и Подолья. Её редкий состав делает её легко узнаваемой и не даёт спутать с другими.