Фамилия Вайтанец — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает любую другую версию. Строение фамилии указывает на западную, скорее всего польскую или белорусскую, модель: суффикс «-ец» (в польском написании -ec) типичен для прозвищных и топонимических фамилий (ср. Ковалец, Полянец, Вольнец). Основа «Вайт-» — это фонетическая передача польского или белорусского слова, восходящего к литовскому «vyti» — «гнать, преследовать» или к балтскому корню со значением «ветвь, побег». В польском языке есть слово «wajda» (от литовского «vaidas» — крик, шум), но для фамилии Вайтанец правдоподобнее выглядит связь с литовским именем Vytas или прозвищем Vytis (всадник, рыцарь). В белорусском языке фамилии на «-анец» (Вайтанец, Лапанец, Баранец) нередко обозначали выходца из определённой местности или сына человека с прозвищем Вайта.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс «-ец» в восточнославянских фамилиях чаще всего указывает на происхождение: «чей-то сын» или «житель такого-то места». В сочетании с основой «Вайт-» получаем «сын Вайта» или «человек из Вайт». Фамилия могла закрепиться за человеком, который пришёл из села или хутора с названием Вайты, Вайтени или Вайтенишки (такие топонимы встречаются в Литве и на северо-западе Беларуси, в бывшем Виленском крае). Альтернативная версия — прозвище Вайтанец давали гонцу, скороходу или тому, кто постоянно кого-то догонял, от литовского «vyti» — «гнать». В польской ономастике есть фамилия Wojtan (от «wójt» — сельский староста), но написание Вайтанец с гласной «а» после «й» указывает именно на литовский или белорусский субстрат, где звук «о» в таких позициях переходил в «а».

Географически фамилия Вайтанец привязана к региону бывшей Речи Посполитой: современная Литва, западная Беларусь, восточная Польша. В метрических книгах XIX века она встречается в Гродненской и Виленской губерниях, реже — на Волыни. Социальный состав носителей — в основном крестьяне и мелкая шляхта (однодворцы). В русском языке фамилия не прижилась из-за непривычного звучания, поэтому её носители в России — это потомки переселенцев с запада после разделов Польши или более поздних миграций. Ударение, судя по аналогии с «полянец», «варшавец», ставится на первый слог: Вáйтанец.

Спорным моментом остаётся возможная связь с немецким «Weiß» (белый) через диалектное «Wajs». Но для фамилии с суффиксом «-ец» это маловероятно: немецкие фамилии на «-ец» в русской передаче единичны и обычно связаны с идишем (Вайсман, Вайнштейн), а не с топонимической моделью. Поэтому версия с литовским происхождением и географической привязкой остаётся основной.