Фамилия Ведэр — редкий случай, когда написание напрямую указывает на западнославянское или балтийское происхождение. В русском языке фамилия с таким окончанием неестественна: исконно русские фамилии оканчиваются на -ов, -ев, -ин, -ский, -их, -ых. Форма на -эр (или -ер) характерна для польских, белорусских, украинских, а также еврейских фамилий, записанных латиницей или адаптированных через идиш. Поэтому первое, что бросается в глаза: Ведэр — не обрусевшая фамилия, а принесённая извне.

Основа «Вед-» отсылает к глаголу «ведать» (знать) или к слову «ведьма» (знающая). В древнерусском языке «вед» — это знаток, колдун, мудрец. Однако суффикс -эр в славянском словообразовании не встречается — он типичен для немецкого или идиша, где -er образует названия профессий (например, Weber — ткач). Если фамилия еврейская, то Ведэр могло означать «знающий», «ведун» — прозвище человека, которого считали сведущим в тайных знаниях или лекарем.

Есть и другая версия: фамилия могла возникнуть из белорусского или польского произношения слова «ведро» (вёдро — ясная погода). В диалектах «вёдэр» — это «вёдро» в родительном падеже (нет вёдра) или форма именительного падежа с твёрдым окончанием. Тогда Ведэр — это прозвище человека, связанного с вёдрами: бондаря, водоноса или торговца. Но эта гипотеза слабее: фамилии от названий предметов обычно образуются с суффиксами -ник, -арь, -ец (Ведерников, Ведерник), а не с -эр.

Встречается написание Ведер (без мягкого знака) — это уже ближе к русской графике. Но именно вариант «Ведэр» с буквой «э» выдает сознательную передачу звука [е] после твёрдого согласного — так пишут в белорусском языке (Ведэр) или в латинской транскрипции (Weder). В любом случае, носитель фамилии Ведэр с высокой вероятностью имеет предков из западных регионов бывшей Речи Посполитой или из еврейских местечек. Географически фамилия редкая: в современных базах данных она почти не встречается, что говорит либо о малочисленности рода, либо о том, что большинство носителей сменили фамилию на более привычную Ведерников или Ведер.