Фамилия Вегапетян происходит от армянского имени Вегапет, которое, предположительно, образовано из двух основ «веге» и «апет». Первая основа восходит к армянскому слову «веге», этимологически связанному с именем Виген со значением «сильный, могущественный». Слово «апет» имеет в армянском языке значение «крепость Божья». В целом, имя Вегапет переводится как «могущественная крепость Божья». Вероятно, имя Вегапет относится к так называемым «обрядовым именам», которые родители давали ребенку, желая, чтобы их сыну сопутствовали успех и благополучие, здоровье и богатство, сила и ловкость. Все эти компоненты первоначально означали «из семьи таких-то» или «из рода таких-то». Таким образом, человек, предка которого звали Вегапет, со временем получил фамилию Вегапетян.