Фамилия Вегара — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет западноевропейские корни. Встречается она в основном на юге России и на Украине, и её происхождение почти наверняка связано с переселенцами XVIII–XIX веков.

Если разбирать фамилию по модели, то перед нами — типичный русский суффикс принадлежности -а, который в украинской традиции часто закреплялся за фамилиями без дополнительных формантов. Но основа — не славянская. Скорее всего, Вегара — это русифицированная форма испанской или итальянской фамилии Vega (Вега) или Vegara. В испанском языке Vega означает «плодородная низина», «луг у реки». Фамилия Vegara — топонимическая, то есть указывает на выходца из местности с таким названием (например, город Вегара в провинции Гранада или район Вега в Астурии).

Как и когда Вегара попала в русскую среду? Вероятнее всего, через греков, армян или евреев-сефардов, которые переселялись в Новороссию и Крым в конце XVIII — начале XIX века. Среди греческих и армянских купцов и ремесленников, приглашённых Екатериной II осваивать южные земли, было немало носителей средиземноморских фамилий. На слух русских чиновников «Вегара» звучала как «Вигара» или «Вегара», и её записывали на слух, без перевода. В результате фамилия закрепилась в метрических книгах Одессы, Херсона, Таганрога.

Интересно, что в отличие от большинства русских фамилий на -а (типа Сковорода, Паливода), ударение в Вегара падает на второй слог — Вега́ра. Это выдает нерусский ритмический рисунок. Иногда фамилию путают с Вегерой (украинская фамилия от диалектного «вегера» — «мелкий торговец»), но это разные корни: Вегера — славянское прозвище, а Вегара — явный «иностранец».

Таким образом, носитель фамилии Вегара — потомок, скорее всего, южного переселенца, возможно, грека или сефарда, чей предок носил испанскую фамилию, указывающую на жизнь у речной поймы. Никакого дворянского титула или боярского рода за ней не стоит — это бытовая, географическая метка, которая прижилась на русской почве.