Фамилия Вегера — редкий случай в русском ономастиконе, когда корень, скорее всего, не славянский, а западноевропейский. Если отбросить случайные совпадения, наиболее обоснованная версия связывает её с испанским словом veguer (веге́р). В средневековых Арагоне, Каталонии и на Мальорке вегером называли королевского чиновника, который вершил правосудие на определённой территории — что-то вроде викария или судьи. Прозвище Вегер могли дать либо такому должностному лицу, либо его слуге или крестьянину, жившему на землях вегера.

Суффикс -а в русской передаче (Вегера вместо Вегер) — типичная адаптация. В украинской и белорусской традиции так часто оформляли фамилии от прозвищ, оканчивающихся на согласный, добавляя к ним окончание -а. Выходит, что носитель фамилии — «потомок Вегера», то есть человека с прозвищем по должности или месту службы.

Есть и альтернативная версия — от французского verger («фруктовый сад»). Она менее правдоподобна: во-первых, переход verger → Вегера требует объяснения пропажи звука r или его перестановки (что нехарактерно), во-вторых, фамилии от названий садов редки в русском контексте и обычно имеют другую модель (Садовников, Садовский).

Что интересно: в России фамилия Вегера встречается в основном на юге и западе — в Краснодарском крае, Ростовской области, на Украине. Это может указывать на то, что предки носителей фамилии имели контакты с испанцами или итальянцами (схожий титул veguer существовал и в Сардинском королевстве) через средиземноморскую торговлю или военные походы, либо фамилия была принесена переселенцами из Польши, где испанские и французские заимствования в шляхетской среде не редкость.

Таким образом, фамилия Вегера — не про сад и не про овощи (как может показаться на слух), а про человека, чей предок мог быть королевским судьёй в средневековой Испании. Редкая, звучная и с чёткой социальной привязкой — к должности, а не к ремеслу или имени.