Фамилия Вегерин — редкая и неочевидная. Её происхождение, скорее всего, связано с западноевропейскими языками, а не с русскими корнями. Основная версия отсылает к испанскому слову «veguer» — «вегер», то есть викарий или королевский чиновник, вершивший правосудие в Арагоне, Каталонии и на Мальорке. Если это так, то прозвище Вегер мог получить человек, служивший судьёй или управляющим, а его потомки стали Вегериными.

Менее убедительная гипотеза возводит фамилию к французскому «verger» — «фруктовый сад». В этом случае прозвище могло указывать на садовника или владельца сада, но такая версия кажется натянутой: фонетический переход от «verger» к «Вегер» менее естественен, чем прямая заимствованная форма «veguer».

Словообразовательная модель проста: к основе Вегер добавлен русский патронимический суффикс -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и означает «сын Вегера» или «принадлежащий Вегеру». По такой же схеме образованы десятки русских фамилий от прозвищ иноязычного происхождения — например, Гофман или Шмидт.

География бытования фамилии сегодня неширокая. Носители Вегериных встречаются в основном на юге России и в Поволжье, что может указывать на миграцию или смешанные браки в прошлом. Никаких документальных подтверждений о дворянском происхождении или принадлежности к конкретному сословию нет — скорее всего, это фамилия человека, получившего прозвище по должности или занятию, а затем усвоенная крестьянской или мещанской средой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то в русском ономастиконе аналогов почти нет. Ближе всего стоит фамилия Вегер, от которой Вегерин и образован. Встречается также вариант Вегера, но он ещё реже. Таким образом, фамилия Вегерин — это редкий пример испанского или каталонского следа в русской фамильной системе, скорее всего, принесённого через контакты с Западной Европой в XVII–XVIII веках.