Фамилия Вильдгрубе — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение лежит не в славянской, а в немецкой языковой среде. Сложносоставная основа читается прозрачно: первая часть «вильд» (wild) переводится как «дикий», вторая «грубе» (Grube) — «яма, ров, шахта». То есть буквально фамилия означает «дикая яма» или, что вероятнее, «дикий ров». Это типичное немецкое прозвище по месту жительства — так могли назвать человека, чей дом стоял у заброшенного, заросшего оврага, или того, кто жил на окраине, у «дикого» (необработанного) рва.

В России фамилия появилась вместе с переселением немецких колонистов в XVIII–XIX веках, прежде всего в Поволжье и на юге империи. Однако в отличие от массовых фамилий вроде Шмидт или Мюллер, Вильдгрубе осталась штучной. Встречается она и сегодня в основном на юге России и в Сибири — там, куда немцев переселяли в советское время. Русское ухо могло переосмыслить концовку: «-грубе» иногда записывали как «-грубый», но это уже вторичное искажение.

Словообразовательная модель здесь не русская: нет суффиксов -ов или -ин, фамилия застыла в виде готового немецкого прозвища. В немецкой ономастике такие топонимические фамилии на -grube встречаются, но нечасто. Например, известна фамилия Зальцгрубе (соляная шахта). Вильдгрубе стоит в том же ряду, но с оттенком не столько профессиональным (шахтёр), сколько описательным — характеристика места.

Если представить, кем мог быть первый носитель, то скорее всего крестьянином или ремесленником, жившим на отшибе немецкой колонии, у оврага или старого карьера. Дворянских корней у фамилии нет — она слишком «земляная» для аристократической родословной. Встречаются варианты написания: Вильдгруб, реже Вильдгрубев (с русифицированным окончанием), но исходная форма сохранилась лучше благодаря своей необычности.