Фамилия Вилгертс — редкий для России пример фамилии, образованной по латышской или ливской модели. Её основа — немецкое личное имя Вильгельм (Wilhelm), которое в балтийском произношении дало форму Вилгерт. Суффикс -с (-s) в конце — типичное латышское окончание мужского рода, указывающее на именительный падеж. Таким образом, Вилгертс буквально означает «(сын) Вилгерта» или просто «Вилгерт», но уже оформленный по грамматическим законам латышского языка.

В Российской империи фамилии на -с встречались в основном у латышей, эстонцев и ливов, живших в Прибалтийских губерниях — Курляндской, Лифляндской, Эстляндской. Носители фамилии Вилгертс, скорее всего, были крестьянами или мещанами из этих регионов. Немецкое имя Вильгельм попало в Прибалтику через остзейских немцев, но сама фамилия закрепилась именно за местным балтийским населением, а не за немецким дворянством.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые указывают на принадлежность отцу, латышский суффикс -с просто оформляет фамилию как существительное мужского рода, не добавляя притяжательного значения. Поэтому Вилгертс не означает «чей-то», а скорее фиксирует прозвище или имя предка в неизменной форме.

Встречается также вариант написания Вилгерц (с заменой -тс на -ц), что связано с особенностями передачи латышских окончаний в русских документах. В самой Латвии фамилия могла писаться как Vilgerts. В России она остаётся крайне редкой и почти всегда указывает на балтийские корни семьи, переселившейся вглубь страны в XIX–XX веках.