Фамилия Вилимовский — редкий пример, где за основу взято не имя, не ремесло, а искажённое название целого города. Речь о Вильне — исторической столице Литвы, нынешнем Вильнюсе. Прозвище Вилимовый, от которого пошла фамилия, скорее всего, давали человеку, который был оттуда родом или долго там жил. Суффикс -ский в русской традиции часто указывал на географическую привязку: так образовывались фамилии дворян и духовенства по месту владения или службы, но у простых людей этот суффикс мог появиться позже, при переходе прозвища в официальную фамилию.

Город Вильна известен с 1323 года как столица великого князя Гедимина. С ним связана легенда о железном волке: князю приснился зверь, который выл, как сотня волков, и жрец растолковал, что на этом месте встанет замок и город, чья слава разнесётся по миру. Само название реки Вильня, левого притока Вилии, и дало имя городу. В XII веке Вильна уже упоминается в русских летописях, так что корни прозвища уходят глубоко.

Вилимовский — не единственная фамилия с такой основой. Встречаются Виленский, Вильневский, Вильчковский — все они отсылают к тому же топониму, но через разные диалектные или документальные формы. Искажение «Вильна» в «Вилимов» могло возникнуть из-за местного произношения или при записи прозвища в польских и русских канцеляриях.

Есть и другая версия, менее убедительная: связь с личным именем Вилим (народная форма от Вильгельм). Но тогда фамилия звучала бы как Вилимов или Вилимович, а суффикс -ский здесь лишний. Географическое объяснение выглядит естественнее: большинство фамилий на -ский в западных губерниях Российской империи образовывали именно от названий городов и местечек.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии Вилимовский жил в Вильне или её окрестностях, а затем перебрался в другой регион, где прозвище закрепилось как фамилия. Учитывая, что город был многонациональным — литовцы, русские, поляки, евреи, — определить точную этническую принадлежность основателя фамилии сложно. Но сама фамилия осталась в русском ономастиконе как память о старом литовском топониме и его долгой истории.