Фамилия Вишякова — один из тех случаев, когда написание подсказывает происхождение больше, чем звучание. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Вишяко́ва, что сразу выдаёт основу: «вишня́к» (вишнёвый сад) или «вишня́к» как прозвище человека, торгующего вишней, живущего у вишнёвых деревьев. Форма на -ов (-а) указывает на типичную модель русской фамилии: «чей?» — потомок человека, которого в быту звали Вишня́к.

Однако на письме фамилия закрепилась через «я», а не через «е» (Вишняков). Это не ошибка, а следствие исторического произношения в некоторых говорах — так называемое «яканье» (произнесение «вишняк» как «вишяк»). В XIX веке при записи фамилий в метрические книги писарь мог записать фамилию на слух, не сверяясь с «правильным» написанием. Так появились варианты-дублеты: Вишняков и Вишяков (и женская форма Вишякова). Встречаются они преимущественно в центральных и южнорусских регионах, где яканье было распространено.

Сама основа «вишняк» — не ремесло, а скорее топографическое прозвище. В старину «вишняком» называли не только сад, но и густой кустарник, заросли. Человек, чья изба стояла у вишнёвой рощи или кто владел таким участком, легко получал уличное имя Вишняк. Реже — прозвище по занятию: торговец вишней или садовод, специализировавшийся на этой культуре.

С точки зрения сословного состава, фамилия не была аристократической. В переписных книгах XVII–XVIII веков Вишняковы — это крестьяне, однодворцы, реже мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что типично для «растительных» прозвищ. Сегодня носителей фамилии Вишякова (и мужской формы Вишяков) значительно меньше, чем Вишняковых, — это редкий вариант, который сохранил живую фонетику говора.

Таким образом, фамилия Вишякова означает «потомок того, кого звали Вишняк» — человека, связанного с вишнёвым садом или зарослями. Написание через «я» — не искажение, а диалектная черта, закреплённая в документах.