Фамилия Воаненко на первый взгляд кажется простой, но при ближайшем рассмотрении ставит перед исследователем несколько загадок. В первую очередь бросается в глаза её нетипичная структура для украинской фамилии с суффиксом -енко. Обычно основа перед этим суффиксом — это имя, прозвище или название профессии (Петренко, Коваленко, Шевченко). Здесь же основа — «Воан», что не является ни распространённым славянским именем, ни очевидным апеллятивом.

Скорее всего, мы имеем дело с фамилией, возникшей на стыке разных языковых традиций. Наиболее вероятная версия — тюркское происхождение основы. В тюркских языках существует имя или прозвище «Воан» (варианты — Боан, Бован), которое могло означать «богатый», «обильный» или восходить к древнему родовому имени. В таком случае фамилия Воаненко — это «сын Воана», то есть потомок человека, носившего такое прозвище или имя. Это типичная модель для украинских фамилий, адаптировавшая иноязычную основу.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «вова» (дядя, старший родственник) или «воя» (воин), но эти гипотезы слабы, так как не объясняют появления звука «н» в середине слова. Искусственное переосмысление фамилии уже в русской или украинской среде тоже могло сыграть роль: носители могли «подогнать» неудобное окончание под привычную модель.

Географически фамилия Воаненко встречается очень редко, преимущественно в южных и центральных регионах Украины, а также в приграничных областях России, что косвенно подтверждает версию о тюркском следе — эти территории исторически были зоной активных контактов с кочевыми народами. Сословного статуса предков по одной фамилии не определить: Воаненко мог быть и казаком, и крестьянином, и мещанином. Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия эта не массовая, а редкая, с неочевидной, но интересной этимологией.