Фамилия Водопшин — редкий пример, где за привычным русским окончанием -ин скрывается украинская основа. В её корне лежит слово «водопiйча» — так на Украине называли кружку для воды. Отсюда и прозвище Водопша, которое могли дать по двум совершенно разным причинам: либо человек слишком много пил воды (водохлёб), либо его работа была связана с доставкой или продажей воды (водовоз). Оба варианта правдоподобны, и выбрать между ними без конкретных семейных преданий невозможно — фамилия одинаково хорошо ложится и на вкусовое пристрастие, и на ремесло.

Интересно, что суффикс -ин указывает на принадлежность: Водопшин буквально означает «сын Водопши». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я, но сама основа «Водопша» в русских говорах не встречается. Это подсказывает, что носители фамилии, скорее всего, происходят из украинских или южнорусских регионов, где слово «водопiйча» было в ходу. Со временем прозвище закрепилось за потомками как фамилия, и сегодня Водопшин — один из тех ономастических следов, которые связывают современную фамилию с бытовой лексикой прошлого.

Иных версий происхождения — от личного имени или географического названия — для этой фамилии нет, поэтому версия с водопойной кружкой остаётся основной и наиболее обоснованной.