Фамилия Водышева — редкий случай, где географическая привязка проступает почти так же отчётливо, как и смысл основы. Сама основа — «вод-» — прозрачна: она отсылает к воде. Но вот суффикс «-ыш-» нестандартен для русских фамилий. В русском языке суффикс «-ыш» чаще встречается в прозвищах или названиях животных (малыш, крепыш, стриж), а в фамилиях он почти не закрепился. Это наводит на мысль, что Водышев — не столько фамилия, образованная от имени, сколько застывшее прозвище.

Скорее всего, в основе лежит не имя, а характеристика человека. Прозвище Водыш могли дать тому, кто жил у воды, работал на воде (перевозчик, рыбак, мельник) или, напротив, отличался водянистым, нерешительным характером — в говорах «водяной» человек означал вялого. Суффикс «-ев» в окончании указывает на принадлежность: Водышев — сын Водыша. То есть фамилия возникла как отчество от прозвища, а не от крестильного имени.

Интересная деталь: в некоторых северных и поволжских говорах «водыш» могло означать не просто воду, а «омутистую яму» или «заливной луг». Тогда прозвище получал хозяин такого угодья или житель рядом с ним. Это объясняет, почему фамилия встречается в основном в регионах с развитой речной сетью — в Вологодской, Кировской, Нижегородской областях. В списках XIX века Водышевы фиксируются среди государственных крестьян именно этих губерний.

Словообразовательная модель редкая: если бы фамилия произошла от имени Водя (как Водяной), она звучала бы как Водин или Водяев. А «-ыш-» — признак того, что прозвище было не просто описательным, а с оттенком уменьшительности или иронии. Так могли окрестить невысокого, юркого человека, который «как вода» проскальзывал в делах. В любом случае, Водышева — фамилия, которая не даёт однозначного ответа, но зато чётко указывает на среду обитания: вода и всё, что с ней связано.