Фамилия Воекова — женская форма фамилии Воеков, и её разбор стоит начать с мужского варианта, потому что именно в нём скрыта загадка. Корень «воек» на первый взгляд кажется необычным: в русском языке нет слова «воек» в прямом значении. Однако здесь работает типичная для русских фамилий модель: основа + суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Воека). Значит, в основе лежало прозвище или неканоническое имя Воек.

Самая правдоподобная версия связывает Воек с диалектным словом «воя» — крик, шум, плач. В некоторых говорах «воек» могли называть крикливого, плаксивого человека или, наоборот, того, кто громко командует, воинственно покрикивает. В словаре В. И. Даля зафиксирован глагол «воять» — кричать, реветь. Таким образом, родоначальник Воековых мог получить прозвище за голос или манеру поведения.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским корнем, где «воек» могло быть искажением имени или прозвища. Однако в русской ономастике тюркские заимствования обычно проходят через стадии адаптации, и форма «Воек» для них нетипична. Поэтому версия с русским диалектным словом выглядит убедительнее.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия сформировалась в среде крестьян или служилых людей XVI–XVII веков, когда патронимические фамилии на -ов стали массово закрепляться. Встречается написание через «ё» — Воёкова, что может отражать произношение в некоторых регионах, где под ударением «ё» звучало как «о».

Среди однокоренных фамилий — Воейков, Вояков, Воинов. Воейков более известна благодаря дворянскому роду, но Воеков — более редкий вариант, сохранивший исходную форму без чередования «й». Если ваша фамилия Воекова, ваши предки с высокой вероятностью были выходцами из северных или центральных губерний России, где диалектное слово «воя» бытовало активнее.