Фамилия Воконская — редкий случай, когда географическая основа почти не вызывает сомнений, а вот её морфология и происхождение исходного названия открывают простор для разбора. Перед нами типично «географическая» фамилия, образованная по модели, характерной для дворянских и шляхетских родов: основа + суффикс -ск-/-цк- и окончание -ая. Такие фамилии указывали на владение местностью или происхождение из определённого места. Воконская — значит «из Воконска» или «из Вокони».

Но где искать этот топоним? Наиболее вероятная версия отсылает к реке Воконь (или Воконка) в бассейне Оки. Название реки имеет финно-угорские корни: в языках меря или мурома «вокс» или «вокша» могло означать «протока», «рукав реки». Соответственно, село или усадьба на такой реке назывались Воконским, а владелец или выходец из него получал фамилию Воконский / Воконская. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются упоминания о деревнях с похожими названиями в нынешних Владимирской и Костромской областях — именно там проходили земли, где финно-угорская гидронимика особенно сильна.

Суффикс -ск- указывает на принадлежность к месту, а не на прямое родство (как -ов/-ев). Поэтому фамилия Воконская исторически могла принадлежать дворянскому роду, получившему именование по своему поместью. Однако не стоит исключать и более позднюю «семинарскую» версию: в духовных училищах иногда давали фамилии по названиям сёл, где служил священник. Если приход стоял на реке Воконь, то выпускник мог стать Воконским.

Двойник фамилии — Воконский (мужской вариант) — встречается в списках мелкопоместного дворянства XIX века, но крайне редко. В женской форме Воконская фамилия фиксируется в метрических книгах в основном в центральных губерниях России, что подтверждает её привязку к Владимирскому и Костромскому регионам. Иных версий — от прозвища или имени — почти нет, потому что корень «вокон-» не имеет славянской лексики (ни «вокно», ни «воконь» в русских говорах не зафиксированы). Так что река — самое надёжное объяснение.