Фамилия Вороницын — один из тех случаев, когда внешне прозрачная основа скрывает неожиданный поворот. На первый взгляд, корень «ворон» наводит на мысль о птице, но здесь работает не она, а уменьшительно-ласкательная форма личного имени. В основе лежит имя Вороня — производное от канонического Варфоломей (через народную форму Ворон). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Вороницын буквально значит «сын Ворони». Но почему не Воронин? В этом и состоит главная особенность.

Фамилия образована не напрямую от прозвища Вороня, а от его патронимической формы Вороница. В древнерусской традиции так называли жену или вдову человека по имени Вороня (ср. Иваниха — жена Ивана). Соответственно, Вороницын — это «сын Вороницы», то есть внук Ворони. Такая двухступенчатая модель встречается реже, чем простой патроним на -ов или -ин, и часто указывает на более позднее закрепление фамилии или на то, что предок был известен именно по материнской линии (в случае вдовства или особого статуса семьи).

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодчине, Костромской и Ярославской губерниям, где были сильны традиции нецерковных имён и уменьшительных форм. Встречается она нечасто: в дореволюционных метрических книгах Вороницыны записаны в основном среди крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это указывает на её однозначно простонародное происхождение.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от прозвища Вороница — так в некоторых говорах называли ворону или человека с чёрными волосами. Но тогда логичнее было бы ожидать фамилию Вороницын с ударением на второй слог, а реальное произношение в документах чаще фиксирует ударение на «и» — Ворони́цын, что поддерживает версию с именем Вороня. Так что, скорее всего, предки носителя этой фамилии были людьми, чей дед носил нецерковное имя Вороня, а отец записан по матери — Вороница.