Фамилия Вовакин — один из тех редких случаев, когда на слух она звучит как нечто восточное или даже вымышленное, но по законам русской ономастики её происхождение почти наверняка укладывается в простую и прозрачную схему. Если отбросить версию о заимствовании из других языков (прямых аналогов в тюркских, кавказских или финно-угорских наречиях нет), то перед нами типичная русская фамилия, образованная по модели «имя + суффикс принадлежности».

Ключ к разгадке — суффикс -ин. В русском языке он присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я, и означал «чей?», «сын кого?». Значит, в основе фамилии лежит прозвище или имя Вовака. Это, в свою очередь, уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Владимир. Цепочка проста: Владимир — Володя — Вова — Вовка — Вовака. Форма Вовака — это нестандартный, диалектный или шутливый вариант, где к основе «Вов» добавили суффикс -ак-/-як-. Такие суффиксы в русских говорах часто придавали слову оттенок просторечия или пренебрежения (ср. «простак», «дурак»), но в имени они могли закрепиться как ласкательное или, наоборот, фамильярное прозвище.

Таким образом, первый носитель фамилии Вовакин — это, скорее всего, человек, которого в деревне или слободе звали Вовакой. Его дети и внуки стали Вовакиными. Географически фамилия редкая и не имеет ярко выраженного «гнезда» в одном регионе, что типично для фамилий, образованных от разговорных форм имени, а не от названий ремёсел или местностей. В дореволюционных переписях она могла встречаться спорадически в разных губерниях, но никогда не входила в число массовых.

Версия о том, что Вовакин — это искажённая форма армянской фамилии Воваян или грузинской Вовадзе, не выдерживает критики: русский суффикс -ин чётко указывает на славянскую словообразовательную модель. Армяне и грузины, получая российское подданство, часто русифицировали свои фамилии, но в таком случае мы бы видели Вовашвили или Вованов, а не «Вовакин». Скорее всего, перед нами чисто русский случай, когда редкая уменьшительная форма имени дала начало ещё более редкой фамилии.