Фамилия Воячек — одна из тех, что сразу выдают не русское, а западнославянское происхождение. Её основа и суффикс указывают на польские или западноукраинские корни. В русской традиции фамилии на «-ек» почти не образуются, зато в польском это уменьшительный суффикс (как в «хлопец» — мальчик). Поэтому Воячек, скорее всего, уменьшительная форма от имени или прозвища Вой, Вояк.

Самая прямая версия: в основе лежит польское слово «wojak» — воин, солдат. Так могли прозвать служивого человека, ветерана или просто драчливого, воинственного мужчину. Суффикс «-ек» придаёт оттенок ласкательности или уменьшительности: «Воячек» буквально значило «маленький воин» или «солдатик». Это могло быть и прозвищем сына того самого Вояка, и обращением к молодому новобранцу.

Менее очевидный, но возможный вариант: от польского имени Войцех (Wojciech), которое тоже восходит к корню «вой» (воин). В обиходе Войцеха могли звать сокращённо — Вояк, а его сына или младшего родственника — Воячек. То есть фамилия могла возникнуть как отчество от народной формы канонического имени.

В польских и украинских метриках XIX века фамилия Воячек встречается в Галиции и на Волыни — регионах, где смешивались польские и украинские говоры. После разделов Речи Посполитой носители фамилии могли оказаться на службе в Российской империи, где окончание «-ек» при письме сохранили, но произносили уже на русский лад. Сословно это, скорее всего, были мещане или крестьяне — шляхтичей с таким «простым» суффиксом почти не бывало.

Любопытная деталь: фамилия Воячек — редкий пример, когда славянское военное прозвище дошло до нас в уменьшительной, почти домашней форме. В русских фамилиях тот же смысл передавали через суффиксы «-ов» (Воинов) или «-ин» (Воинкин), а здесь сохранилась интонация польской речи, где даже «вояку» могли назвать ласково.