Фамилия Войпанюк — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а почти наверняка прозвище. Если разобрать её по составу, сразу бросается в глаза суффикс -ук, типичный для западноукраинских и белорусских фамилий (особенно для Волыни, Полесья, Подолья). Он заменял собой великорусское окончание -ов или -ин и указывал на принадлежность: чей сын? — Войпанюк.

Корень здесь составной: Вой-пан. Самая правдоподобная версия — что это сращение двух слов: «вой» (от «вояка», «воин» или даже глагола «выть») и «пан» (господин, помещик). Прозвище Войпан мог получить человек с громким, властным голосом, либо тот, кто вёл себя как «воинствующий барин» — задира, который кичился своей силой. В польском и украинском просторечии «вой» могло означать и крик, и плач, так что возможен и ироничный оттенок: «плачущий пан» — барин, который вечно ноет.

Менее вероятная, но допустимая версия — искажение имени или тюркского прозвища. Например, от тюркского «бай» (богатый, господин) и «пан», что дало бы двойное обозначение знатности. Но для украинской ономастики это экзотика: проще объяснить фамилию местным народным прозвищем, чем заимствованием.

Географически фамилия привязана к западным областям Украины — скорее всего, к Волыни или Ровенщине. В дореволюционных метриках и ревизских сказках она почти не встречается, что говорит о её позднем закреплении (вторая половина XIX века) и о крестьянском или мещанском происхождении носителей. Дворянской фамилией Войпанюк не была — суффикс -ук в среде шляхты встречался редко, обычно у однодворцев и казаков.

Сравните с однокоренными, но более распространёнными фамилиями: Войпанов (русская адаптация), Войпаненко (с украинским суффиксом -енко, означающим «сын»). Вариант на -юк — самый локальный, он подчёркивает, что предок жил на территории, где говорили на полесских говорах.

Таким образом, Войпанюк — это прозвищная фамилия, возникшая в крестьянской среде западноукраинских земель. Первый носитель, скорее всего, был человеком с резким нравом или громким голосом, за что и получил ироничное прозвание «воинственный пан».