Фамилия Войтюховская — яркий пример того, как географическое имя превратилось в родовое. Её основа — название населённого пункта, скорее всего, Войтюховка или Войтюхово. Такие топонимы встречаются на западе современной Украины, в Беларуси и восточной Польше — на землях, где веками переплетались славянские, литовские и польские традиции. Суффикс -ск- указывает на принадлежность к месту, а окончание -ая — на женский род, то есть носительница фамилии — потомок того, кто был «из Войтюхова» или «войтюховский».

Корень «Войт-» восходит к польскому wójt или украинскому війт — «староста», «сельский голова» или «войт» (должностное лицо, управлявшее общиной). Это слово, в свою очередь, пришло из немецкого Vogt (управляющий, судья). Так что в основе фамилии лежит прозвище или должность предка: «Войтюх» — уменьшительно-ласкательная форма от «войт». В старину так могли называть сына войта или человека, служившего у войта. Войтюховский, а затем Войтюховская — это притяжательная форма: «чей?» — «войтюховский», то есть принадлежащий к роду Войтюхов или выходец из Войтюхова.

Интересно, что фамилия сохранила мягкий вариант суффикса -юх-, что типично для юго-западных говоров. В отличие от более частых «Войтович» или «Войтенко», форма Войтюховская встречается реже и имеет выраженный региональный оттенок — она характерна для Волыни, Подолья и Галиции. Сословно носители этой фамилии могли быть как крестьянами, так и мещанами или мелкой шляхтой — в Речи Посполитой многие сельские войты получали шляхетство, но чаще должность была выборной и не давала привилегий.

Сегодня фамилия Войтюховская остаётся сравнительно редкой. Её носители живут в России, Украине, Беларуси и в диаспорах. Написание с окончанием -ая (а не -а) — это русифицированная форма, закрепившаяся в документах XIX–XX веков. В польском оригинале фамилия звучала бы как Wojtuchowska.