Фамилия Воюта — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, а значит, перед нами либо усечённая форма, либо фамилия, застывшая в виде чистого прозвища. Чаще всего такие фамилии встречаются на западе и северо-западе России, в зоне влияния белорусского и украинского языков, где словообразовательные модели были иными.

Скорее всего, в основе лежит древнерусское или диалектное слово «вой» — воин, боец. В этом случае Воюта — это прозвище воинственного, драчливого человека. Суффикс -ута характерен для древних новгородских и псковских имён и прозвищ (сравните: Густа, Молота, Толбута). Он придаёт основе оттенок принадлежности или свойства: Воюта — буквально «воинственный», «тот, кто воюет». В пользу этой версии говорит и то, что в старых писцовых книгах встречаются похожие прозвища — Вой, Воец, Воюк.

Есть и менее очевидный вариант: фамилия могла возникнуть от имени Воюта как уменьшительной формы от православного имени Войтех (чешское Vojtěch, польское Wojciech). Это имя было популярно у католиков, но проникало и в западные русские земли. Тогда Воюта — это не прозвище, а разговорный вариант полного имени, которое со временем закрепилось как фамилия.

Географически фамилия Воюта тяготеет к Брянской, Смоленской областям и к востоку Беларуси. В этих краях часты фамилии без суффиксов, образованные напрямую от прозвищ или имён. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а не дворянами: в списках служилого сословия такая фамилия не встречается. Сегодня Воюта — большая редкость, что делает её ценной для тех, кто ищет свои корни: чем реже фамилия, тем легче проследить её историю по архивам.