Фамилия Вражетор — редкая и необычная по звучанию. Её происхождение, скорее всего, не связано с исконно русскими корнями, а указывает на искусственное или книжное образование. Самый вероятный путь — семинарская фамилия.

В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали фамилии, образованные от латинских или греческих слов, часто с возвышенным, символическим значением. В основе фамилии Вражетор лежит латинское слово vindex (защитник, мститель) или vindico (защищать, мстить). Вторая часть «-тор» — типичный латинский суффикс деятеля (как в словах «доктор», «лектор», «ревизор»). Таким образом, Вражетор — это «защитник», «отмститель» или «победитель» (возможно, переосмысление латинского victor — победитель, смешанное с vindex).

Такие фамилии были призваны украшать носителя, давать ему благозвучное, «учёное» имя, подчёркивающее его роль в борьбе с пороками или защите веры. В отличие от крестьянских или купеческих фамилий, образованных от прозвищ или профессий (Кузнецов, Попов), семинарские фамилии часто звучали вычурно и были уникальны для каждой семьи. Вражетор могла быть дана выпускнику, показавшему особое усердие в диспутах или проповедях, либо просто по произволу наставника.

Вторую, менее правдоподобную версию можно связать с южнославянским или румынским влиянием. В румынском языке есть слово vrăjitor (колдун, волшебник), которое могло попасть в русскую среду через переселенцев или литературу. Однако для фамилии русского священника такая основа («колдун») маловероятна, хотя полностью исключать её нельзя — иногда фамилии давали и по ироническим прозвищам. Но семинарская версия с латынью выглядит гораздо логичнее, учитывая общую моду на «учёные» фамилии среди духовенства.

Географически фамилия Вражетор, скорее всего, прикреплена к конкретному роду из центральных или южных губерний Российской империи, где были сильны духовные учебные заведения. Носителей её крайне мало, и в современных справочниках она не фиксируется как массовая. Это именно родовая, почти уникальная фамилия, возникшая в узкой среде — скорее всего, в семинарии.