Фамилия Вячкилева — довольно редкая, и её происхождение неочевидно. Чтобы разобраться, смотрим на основу и суффикс. Окончание -ева указывает на женскую форму, а мужской вариант — Вячкилев. Суффикс -ев (или -ов) стандартно означает «сын» или «принадлежащий», то есть Вячкилев — это «сын Вячкиля».

Самая вероятная версия связывает основу «Вячкил» с диалектным или старым русским прозвищем. Слово «вячкать» (или «вякать») в ряде говоров означало «говорить невнятно, мямлить, издавать негромкие звуки». Вологодские и архангельские говоры знают глагол «вячать» — «плакать, хныкать». Человек, которого прозвали Вячкило или Вячкиля, мог быть неразговорчивым, тихим или, наоборот, надоедливым нытиком. Суффикс -ил- в таких прозвищах типичен для характеристики человека по действию (ср. «зубрила», «чертила»). Прозвище Вячкиля могло закрепиться за отцом, а его сын стал Вячкилевым.

Вторая, менее распространённая гипотеза — связь с тюркскими корнями. В татарском языке есть слово «вяк» (время, пора) или «вячке» (мелкий, небольшой). Однако географическое распространение фамилии (она встречается в основном в центральных и северных областях России, а не в Поволжье) склоняет к славянской версии. К тому же, модель образования с суффиксом -ев от прозвища на -я — типично русская, а не тюркская.

Фамилия не дворянская и не купеческая — в старых ревизских сказках и переписях такие фамилии чаще всего встречаются у крестьян и мещан. Носители фамилии Вячкилевы могли быть выходцами из Вологодской, Костромской или Архангельской губерний, где бытовали соответствующие диалектные слова. Из-за редкости фамилия не обросла мифами и не имеет известных исторических носителей, что делает её почти чистым «слепком» с живого прозвища XVII–XVIII веков.