Фамилия Выпанасенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, самой распространённой на Левобережной и Степной Украине. Суффикс -енко исторически означал «маленький», «сын» или «потомок», поэтому фамилия буквально читается как «сын Выпанаса». В основе лежит имя Выпанас — разговорная, народная форма канонического крестильного имени Ипатий (в русской традиции Ипат). Имя это греческого происхождения (hypatos — «высочайший», «консул») и в святцах встречается редко, что и породило множество просторечных вариантов вроде Панас, Опанас, а на юге — и Выпанас.

У фамилии есть любопытная особенность: начальное «Вы-» вместо привычного «О-» или «Па-». Это результат региональной фонетики. В южных и западных говорах Украины, особенно в диалектах Подолья и части Полтавщины, гласный звук в начале слова мог редуцироваться или заменяться на более чёткий «ы». Так Ипат превратился в Панаса, а затем, с приставкой-протезой для удобства произношения, — в Выпанаса. То есть Выпанасенко — не «выпавший» и не «панасенко с приставкой», а именно потомок человека, которого в быту звали Выпанас, что равнозначно Ипатию.

С точки зрения сословного происхождения фамилии на -енко в XVII–XVIII веках были типичны для казацкой старшины, мещан и крестьянства. Среди запорожских казаков и реестрового казачества Гетманщины такие именования фиксировались повсеместно. Однако Выпанасенко — фамилия нечастотная, не «гетманская», а скорее рядовая, сельская. Её носители, вероятно, были людьми служилыми или вольными хлеборобами, а само прозвище Выпанас могло закрепиться за человеком выделяющимся — например, за единственным в селе, кто носил редкое церковное имя Ипат.

В современной Украине фамилия встречается рассеянно, но с заметным тяготением к центральным и южным областям — Черкасской, Кировоградской, Днепропетровской. В России она редка и обычно фиксируется у потомков переселенцев с Украины времён Столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций XX века. Орфографических вариантов немного: изредка пишут Выпанасенко через твёрдый знак (Выпанасенко) или путают с более массовой фамилией Панасенко, но корень «Выпан-» чётко отделяет её от однокоренных.