Фамилия Высеканцев — редкая и прозрачная по происхождению, хотя и не сразу угадываемая на слух. В её основе лежит глагол «высекать» (вырубать, выбивать из камня или металла). Человек, от которого пошла фамилия, мог заниматься разными ремёслами: быть камнетёсом, скульптором, кузнецом, работающим с чеканкой, или даже крестьянином, высекавшим огонь кресалом. Но самая вероятная версия — прозвище Высеканец или Высекан получил тот, кто высекал (вырубал) лес под пашню, то есть подсекал деревья. В русских говорах «высекать» означало расчищать участок под посев, срубая и сжигая лес. Такое занятие было обычным для земледельцев северных и центральных губерний, где господствовало подсечно-огневое земледелие. Прозвище закрепилось за главой семьи, а его потомки стали Высеканцевыми.

Фамилия образована по продуктивной модели: основа (Высекан) + патронимический суффикс -ец (указывающий на принадлежность к роду или местности) + окончание -ов. Получается «чей?» — Высеканцев, то есть сын Высеканца. Суффикс -ец в таких фамилиях встречается нечасто, он придаёт слову конкретно-бытовой оттенок: Высеканец — человек, отличающийся занятием высеканием.

Поскольку фамилия редкая, её география узка. Она встречается в основном в южнорусских областях (Воронежская, Ростовская, Волгоградская) и на Украине, что косвенно подтверждает связь с земледельческим термином, а не с камнетёсным делом. В центральных и северных областях фамилия почти не фиксируется.

Словообразовательно фамилия близка к Высекалов, Высекаев, но суффикс -анцев (через -ец) делает её уникальной. В дореволюционных переписях носители Высеканцевых, скорее всего, относились к государственным или бывшим помещичьим крестьянам, занимавшимся хлебопашеством. Дворянских родов с такой фамилией не известно — это чисто крестьянская или ремесленная фамилия, сохранившая память о тяжёлом труде предков.