Фамилия Вытопоренко — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с конкретным орудием труда, а не с абстрактным качеством человека. Корень здесь — «топор», а приставка «вы-» указывает на действие, направленное наружу или на завершённость процесса. «Вытопорить» в говорах значило «вырубить топором», «вытесать», а иногда — «грубо обработать». Носитель прозвища Вытопор, скорее всего, был плотником или лесорубом, причём не рядовым, а тем, кто делал грубую, первичную обработку дерева: вырубал пазы, вытёсывал брёвна, снимал кору. Прозвище могло закрепиться и за человеком с резкими, «рублеными» чертами лица или характера, но первая, ремесленная версия выглядит убедительнее.

Суффикс «-енко» — типичный для украинской и южнорусской ономастики, он указывает на «сына» или «потомка»: Вытопоренко буквально «сын Вытопора». Такая модель образования фамилий была особенно распространена в Левобережной Украине, на Слобожанщине и в южных уездах России в XVII–XVIII веках, когда фиксация прозвищ по отцу становилась массовой. Это значит, что предки современного носителя фамилии жили, вероятнее всего, в чернозёмной полосе или на территории современной Украины, где плотницкое дело было одним из основных ремёсел.

Интересно, что фамилия сохранила редкую приставку. Существуют однокоренные фамилии — Топоренко, Топоров, Топорков, но Вытопоренко стоит особняком: приставка «вы-» конкретизирует действие, делая прозвище более узким и профессиональным. В словарях восточнославянских фамилий эта фамилия не относится к числу частых, что говорит о локальном бытовании — возможно, в одном-двух сёлах или казачьих станицах прозвище закрепилось за целым родом плотников.

В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается в основном в Харьковской, Полтавской и Воронежской губерниях. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей — ремесло плотника в этих краях не считалось «низким», а давало определённый достаток и уважение. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что только подтверждает её честное трудовое происхождение.