Фамилия Выйкитова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд она кажется искажённой или искусственной, но при разборе по частям проясняется её вероятная основа.

Ключ к пониманию — суффикс -ов/-ев. Он указывает на то, что фамилия образована от мужского имени или прозвища, оканчивающегося на твёрдый согласный. В данном случае базовая форма — Выйкит (или, что более вероятно для женского окончания, — Выйкитов). Само слово «Выйкит» в русском языке не встречается, поэтому его нужно рассматривать как адаптированное заимствование или диалектное прозвище.

Наиболее правдоподобная версия — связь с коми-зырянским языком. В лексике коми есть слово «вы́й» — «масло», «жир». Суффикс -ит мог быть уменьшительным или указывать на признак. Таким образом, «Выйкит» — «масляный», «жирный». В говорах северных русских областей, где было сильное коми влияние, такое прозвище могло закрепиться за сытым, зажиточным человеком, либо за торговцем маслом, скотом. Фамилия Выйкитова тогда означает «потомок Выйкита» (сын или дочь того, кого прозвали Масляным).

Вторая версия, менее вероятная, — искажение фамилии Войкитова. Войкитов (от имени Войко, Войка) — вариант фамилии от краткой формы славянского имени Воислав. Но в таком случае в основе лежало бы «вой» (воин, битва), а не «вый». Разница в произношении и написании принципиальна: «ой» против «ый» — это разные корни.

Фамилия, скорее всего, недворянская и нестарая. Суффикс -ов типичен для крестьянских и мещанских фамилий центра и севера России, которые оформились в XVIII–XIX веках. Поскольку исходное прозвище редкое и связано с местным диалектом, носителей Выйкитовых следует искать в районах бывшего расселения коми-зырян — в Республике Коми, Архангельской, Кировской областях. Географическая привязка здесь важнее, чем для распространённых фамилий.