Фамилия Ячейникова образована от прозвища Ячейник. Оно ведет свое начало от нарицательного «ячейка» со значением «углубление, дырочка и т.п.», «небольшой окоп для одиночного стрелка». Вероятно, прозвище относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на деятельность основателя фамилии: он мог быть бортником-пчеловодом или же военным, стрелком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ячейник, со временем получил фамилию Ячейникова.