Фамилия Ягофоров — редкая и неочевидная. Если отбросить суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Ягофора), перед нами основа «Ягофор». Сразу бросается в глаза, что это не славянское имя или прозвище, а скорее всего, вариант канонического христианского имени.

Вероятнее всего, в основе лежит имя Егор (Георгий). В народной речи, особенно в южнорусских и украинских говорах, звук «е» мог переходить в «я» (ср. «Ягор» — народная форма имени Егор). А суффикс -фор- — это искажённое окончание -фёр или -фир, которое могло возникнуть под влиянием греческих имён (например, Христофор). Таким образом, Ягофор — это простонародная, диалектная версия имени Егорий или Георгий, прошедшая через несколько ступеней переосмысления. Человек по имени Ягофор (или его отец) получил фамилию по отцу: «сын Ягофоров».

Менее вероятна, но возможна версия, связывающая фамилию с тюркским корнем «яг» (масло, жир) или «яглы» (маслянистый). В таком случае прозвище Ягофор мог получить человек, занимавшийся торговлей маслом или имевший отношение к скотоводству. Однако против этой гипотезы говорит отсутствие характерных тюркских суффиксов в фамилии, а также то, что форма «Ягофор» больше похожа на адаптированное имя, чем на прозвище по занятию.

География фамилии, судя по скудным данным, тяготеет к регионам, где было распространено аканье и диалектное произношение имени Егор как «Ягор» — это юг России, некоторые области Украины и, возможно, старообрядческие поселения. Носители фамилии могли быть крестьянами или казаками, получившими фамилию по имени деда или отца в XIX веке, когда фамилии массово закреплялись за бывшими государственными крестьянами.

Что касается известных носителей, то в открытых источниках фамилия практически не встречается, что подтверждает её редкий, локальный характер. Это не дворянский род и не фамилия, попавшая в исторические хроники — скорее всего, это «фамилия одного села», которая сохранилась в узком кругу потомков.