Фамилия Ягонченко, предположительно, образована от имени Ягонка, которое является производной формой имени Георгий. Оно в переводе с греческого языка означает «земледелец». В русском языке оно закрепилось в трех формах: церковной – Георгий, скандинавской, пришедшей с варягами, - Юрий, и русской разговорной - Егор (Егорий). Форма Ягонка возникла в результате ряда модификаций имени Егор: Егор — Егоня — Егонка — Ягонка. Одним из покровителей имени Георгий считается святой великомученик Георгий Победоносец – воин, который во время гонений на христиан объявил себя последователем Христа, обличал царя-язычника в нечестии, за что после великих мучений был обезглавлен в 303 году. Возможно также, что имя Ягонка восходит к белорусскому нарицательному «ягня» - «ягненок». Давая младенцу такое имя, как Ягонка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. Таким образом, потомок человека, которого звали Ягонка со временем получил фамилию Ягонченко.