Фамилия Ягубчикова — яркий пример того, как географическое разнообразие и диалектные особенности русского языка порождают редкие фамилии, не укладывающиеся в простые схемы. Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Ягубка, которое, в свою очередь, образовано от имени Ягуб. Это имя — одна из народных, «просторечных» форм канонического имени Иаков (Яков). В русском языке, особенно в южных и западных регионах (на границе с украинскими и белорусскими говорами), звук «я» на месте начального «я» в заимствованных именах — обычное дело. Сравните: Яков и Ягуб (через промежуточные формы Якуб, Якубка). Таким образом, первый и самый очевидный пласт: Ягубчиковы — потомки человека по имени Ягуб, то есть Якова.

Однако суффикс -чик- в основе (Ягуб-чик-ов) заставляет задуматься. В русской антропонимии суффикс -чик- редко выступает просто уменьшительным (как в «Ягубка»). Чаще он указывает на профессиональную или социальную принадлежность: извозчик, переплётчик, бондарчик. Но в случае с личным именем Ягубчик — это, скорее всего, именно ласкательно-уничижительная форма, характерная для семейного или деревенского обихода. Такая модель (имя + -чик) типична для фамилий, образованных от прозвищ детей или младших членов семьи: «Ягубчик» — маленький Ягуб, сын Ягуба.

Спорным остаётся вопрос: могла ли фамилия возникнуть не от имени, а от прозвища по роду занятий? В некоторых говорах «ягубка» — это нечто вроде «ягода», «ягодка», но это маловероятно: для ягодных прозвищ есть более привычные суффиксы (-ин, -ов). Версия с тюркским корнем (от «ягуб» — «близкий», «друг») тоже возможна, но она менее убедительна, так как фамилия имеет чёткую славянскую словообразовательную модель: корень + суффикс -чик- + фамильный суффикс -ов. Тюркское влияние могло сказаться на звучании имени (Ягуб вместо Якуб), но сама фамилия — чисто русская.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью, где были сильны украинские диалектные влияния и где имя Ягуб (Якуб) встречалось чаще, чем в северных областях. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальный, «гнездовой» характер: скорее всего, все Ягубчиковы — потомки одного человека или одной семьи из конкретного села.

Таким образом, фамилия Ягубчикова — это не просто «сын Якова», а более конкретное указание: «сын младшего Якова» или «сын Ягубчика». Она несёт в себе отпечаток диалектной фонетики (Ягуб вместо Якуб) и бытовой модели именования, где уменьшительная форма на -чик закреплялась за целым родом. Искать её корни стоит в южнорусских говорах, где имя Яков звучало как Ягуб, а ласковое обращение «Ягубчик» стало фамильным прозвищем.