Фамилия Яковкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Яковкин послужило церковное имя Яков. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Основой же при образовании фамилии послужила его просторечная форма — Яковка. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яковка, со временем получил фамилию Яковкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Яковкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Яковкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.