Фамилия Якшамин — редкий случай в русской ономастике, где в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, звукоподражательное прозвище. Корень «якш-» в русских говорах и родственных славянских языках имеет значение «говорить невнятно, картавить, заикаться» или «болтать без умолку». В словаре Владимира Даля глагол «якшаться» означает знаться, водиться, дружиться, но в основе этого слова лежит именно звукоподражание «як-як» — нечленораздельной речи. Таким образом, Якша — это человек с невнятной дикцией, картавый, либо, наоборот, говорливый и назойливый собеседник.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Якшамин — «сын Якши» или «человек из рода Якши». Такие фамилии типичны для северных и центральных регионов России, где отчества и прозвища на -ин закрепились в качестве фамилий ещё в XV–XVI веках. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще происходили от имён на твёрдый согласный (Иван — Иванов), -ин прикреплялся к основам на -а или -я (Якша — Якшамин, Кузьма — Кузьмин).

Географически фамилия редкая и локальная. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в Поволжье, в частности в Нижегородской области и в Чувашии. Это не случайно: в местных говорах слово «якша» сохранилось как прозвище не только для косноязычного, но и для суетливого, непоседливого человека. Есть также версия, что в отдельных диалектах «якша» могло означать «ястреб» или «хищная птица», но это предположение слабо подтверждено лексикографическими источниками.

С точки зрения социального статуса, Якшамины, скорее всего, крестьяне или посадские люди. Фамилии от прозвищ, а не от канонических имён, обычно получали простые сословия. Дворянские роды с такой фамилией не известны — в «Общем гербовнике» и списках служилых людей она не встречается.

У фамилии есть однотипные параллели: Якшин, Якшов, Якшеев. Все они образованы от одного корня, но разными суффиксами. Якшамин стоит особняком — суффикс -амин нетипичен для русских фамилий, он скорее характерен для тюркских заимствований (Аминов, Салимов). Однако в данном случае это чисто русское образование: основа Якш- + уменьшительный или прозвищный суффикс -ам- (как в «дядам», «тетям») + -ин. Такая модель встречается редко, что делает фамилию особенно интересной для этимологов.