Фамилия Якшиянц — один из ярких примеров того, как русская письменность закрепила иноязычную модель фамилии. Её основа — тюркское слово «якши» (хороший, добрый, красивый), широко распространённое в языках от татарского до турецкого. Такие «говорящие» прозвища в прошлом давали человеку по его качествам: Якши — значит «хороший парень», «молодец». В роли фамильного суффикса здесь выступает армянский патронимический формант -янц (в русской передаче часто -янц, -ян), указывающий на принадлежность к роду. Получается, что Якшиянц — это «из рода Якши», потомок того, кого прозвали Добрым.

Словообразовательная модель необычна: тюркское корневое слово соединилось с армянским фамильным показателем. Это указывает на среду бытования фамилии — армянские общины, долгое время жившие в тюркоязычном окружении (например, в Крыму, на Северном Кавказе или в Закавказье). Носители фамилии — скорее всего, потомки армян, усвоивших тюркское прозвище ещё до того, как фамилии закрепились официально. В самой Армении фамилия встречается реже, чем у армянской диаспоры в России и Краснодарском крае.

В русском языке фамилия склоняется по правилам мужского рода: Якшиянца, Якшиянцу и так далее. Женский вариант не склоняется. Ударение, судя по живому произношению, падает на последний слог: Якшия́нц. Встречаются варианты написания через «о» (Якшиянц) и с одной «ц» на конце (Якшиянц), но нормативная форма закрепилась с двумя согласными.

Поскольку фамилия редкая и поздняя по времени фиксации, о сословном составе первых носителей судить трудно. Скорее всего, это были ремесленники, торговцы или крестьяне — основная масса армянского населения, получившего фамилии в XIX веке. Дворянских родов с такой фамилией не известно.