Фамилия Якубинский образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якубинский послужило церковное имя Иаков. Мужское крестильное имя Иаков в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». Скорее всего, основатель рода Якубинских был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якуб, со временем получил фамилию Якубинский. О точном месте и времени возникновения фамилии Якубинский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якубинский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.